Unterschied zwischen Southern Blotting und Western Blotting

Autor: Monica Porter
Erstelldatum: 22 Marsch 2021
Aktualisierungsdatum: 5 Juli 2024
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Difference between Southern and northern blotting and western blotting
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Inhalt

Hauptunterschied

Der Hauptunterschied zwischen Southern Blotting und Western Blotting besteht darin, dass das Southern Blotting eine Technik ist, die zum Nachweis eines bestimmten DNA-Fragments in einer bestimmten Probe verwendet wird, während das Western Blotting zum Herausfinden eines bestimmten Proteins in einer bestimmten Probe verwendet wird.


Southern Blotting gegen Western Blotting

Blotting ist eine Technik, mit der Wissenschaftler verschiedene Arten von Molekülen aus einem Gemisch oder einer Probe trennen. Bei dieser Technik bewegen sich Makromoleküle wie Nukleinsäuren (DNA und RNA) und Proteine ​​in einer Mischung durch eine Gelplatte. Hier bewegen sich winzige Partikel schneller als die größeren. Diese Moleküle werden gegen die Oberfläche einer immobilisierten Membran gedrückt, die die Moleküle auf die Membran überträgt. Es gibt verschiedene Arten von Blotting auf der Basis des Nachweises von spezifischem Material, d. H. Southern-Blotting, Northern-Blotting und Western-Blotting. Southern-Blot ist die Art des Blots, die zum Nachweis von DNA verwendet wird, während Western-Blot zum Auffinden von Protein verwendet wird. Das Southern-Blotting wurde 1975 von Edward M. Southern entwickelt. Daher ist es als Southern-Blotting bekannt. Auf der anderen Seite wurde das Western Blotting 1979 von George Starks Gruppe an der Stanford University entwickelt. Dieser Name wurde verwendet, um mit dem Southern Blotting übereinzustimmen. Southern-Blotting wird verwendet, um eine bestimmte DNA-Sequenz herauszufinden, während Western-Blotting verwendet wird, um eine bestimmte Aminosäure- oder Proteinsequenz herauszufinden.


Vergleichstabelle

Southern BlottingWestern Blotting
Eine Technik, die verwendet wird, um eine bestimmte DNA-Sequenz in einem bestimmten Gemisch herauszufinden, wird als Southern-Blotting bezeichnet.Eine Technik, die verwendet wird, um eine bestimmte Aminosäuresequenz des Proteins in einer gegebenen Mischung herauszufinden, ist als Southern-Blotting bekannt.
Entwickelt von
Das Southern Blotting wurde 1975 von Edward M. Southern entwickelt.Western-Blot wurde 1979 von George Starks Gruppe an der Stanford University entwickelt.
Art der Erkennung
Southern-Blotting wird verwendet, um eine bestimmte DNA-Sequenz herauszufinden.Western Blot wird verwendet, um eine bestimmte Aminosäure- oder Proteinsequenz herauszufinden.
Prinzip
Es funktioniert nach dem Prinzip der Hybridisierung.Es funktioniert nach dem Prinzip der Immundetektionsverfahren oder Antigen-Antikörper-Wechselwirkung.
Sonde
Eine einzelsträngige DNA oder manchmal RNA wird als Sonde verwendet.Primär- und Sekundärantikörper werden als Sonde verwendet.
Gelelektrophorese
Die Agarose-Gelelektrophorese wird beim Southern-Blotting verwendet.SDS-PAGE / Polyacrylamid-Gel zur Trennung von Proteinen im Western Blot
Blotting-Verfahren
Das Southern-Blotting folgt dem Kapillartransferverfahren.Western Blotting folgt dem elektrischen Übertragungsverfahren.
Stichprobe
Während des Southern-Blots muss die Probe denaturiert werden.Während des Western-Blots sollte sich die Probe in ihrem ursprünglichen Zustand befinden.
Blockierung
Beim Southern-Blotting ist kein Schritt wie das Blockieren beteiligt.Während des Western Blots werden mit Hilfe von Milchpulver oder Rinderserumalbumin (BSA) unspezifische Antikörperstellen auf dem Nitrozellulosepapier blockiert.
Kennzeichnungsmethoden
Übliche Markierungsmethoden, die beim Southern-Blotting verwendet werden, sind die Verwendung von chromogenen Farbstoffen oder die radioaktive Markierung oder fluoreszierende Markierung usw.Markierungsmethoden, die beim Western-Blotting verwendet werden, sind die Verwendung von fluoreszenzmarkierten Antikörpern oder radioaktiver Markierung, chromogenen Farbstoffen oder die Bildung von Diaminobenzidin usw.
Nachweismethoden
Die Detektion von Licht, Autoradiographie und Farbveränderungen werden als Detektionsmethoden beim Southern-Blotting verwendet.Nachweismethoden im Western Blot sind Farbveränderungen und der Nachweis von Licht usw.
Anwendung
Southern Blot wird zum Nachweis von DNA, Vaterschaftstests, zur Identifizierung von Opfern, zur Identifizierung von Straftätern, zum Auffinden von Infektionserregern und zur Identifizierung von Mutationen oder zur Neuordnung von Genen usw. verwendet.Western Blot wird verwendet, um die Anzahl von Proteinen in einer Mischung zu bestimmen, um das Vorhandensein von HIV, Viren und Bakterien usw. im Serum festzustellen, um defekte Proteine ​​herauszufinden, und wird als eindeutiges Maß für Herpes, Hepatitis B, Lyme verwendet Krankheit und Creutzfeldt-Jacob-Krankheit usw.

Was ist Southern Blotting??

Southern Blotting ist das älteste von Edwin Southern als Southern Blotting bezeichnete Blotting-Verfahren. Es wird verwendet in einer gegebenen Probe oder das Gemisch eine spezifische DNA-Sequenz zu ermitteln. Die Schritte, die während des Southern-Blots durchgeführt werden, sind Elektrophorese, Transfer und Nachweis spezifischer Sequenzen. Zunächst wird die DNA mit Hilfe eines spezifischen Restriktionsenzyms fragmentiert. Dann werden gewünschte DNA-Fragmente durch Gelelektrophorese aufgetrennt. Diese Fragmente werden mit Hilfe einer alkalischen Lösung, z. B. NaOH usw., denaturiert, um die beiden DNA-Stränge zu trennen. Diese einzelsträngigen DNA-Fragmente werden dann durch Blotting auf eine Membran übertragen. Diese membrangebundene DNA wird dann mit einer markierten Sonde behandelt. Diese Sonde bindet sich an ihren komplementären Strang auf der Membran-DNA, der durch ein Autoradiogramm usw. sichtbar gemacht werden kann.


Was ist Western Blotting??

Die Western-Blot-Methode wurde von der Gruppe von George Stark an der Stanford University erfunden, mit der eine bestimmte Sequenz von Aminosäuren im Protein identifiziert wird. Es ist auch als Protein-Blot oder Immun-Blot bekannt. Die Schritte während des Western-Blots sind Elektrophorese, Transfer und Nachweis spezifischer Proteine. Zunächst homogenisieren Sie die Mischung. Dann trennen Sie das Molekül von Interesse mit Hilfe der Elektrophorese. Übertragen Sie diese Moleküle auf die Membran und identifizieren Sie das spezifische Protein unter Verwendung einer spezifischen Sonde.

Hauptunterschiede

  1. Eine Technik, die verwendet wird, um eine spezifische DNA-Sequenz in einer gegebenen Mischung herauszufinden, ist als Southern-Blotting bekannt, wohingegen eine Technik, die verwendet wird, um eine spezifische Aminosäuresequenz des Proteins in einer gegebenen Mischung herauszufinden, als Southern-Blotting bekannt ist.
  2. Das Southern Blotting wurde 1975 von Edward M. Southern entwickelt und ist als Southern Blotting bekannt. Andererseits wurde das Western Blotting 1979 von George Starks Gruppe an der Stanford University entwickelt.
  3. Southern-Blotting wird verwendet, um eine bestimmte DNA-Sequenz herauszufinden. Umgekehrt wird Western Blot verwendet, um eine bestimmte Aminosäure- oder Proteinsequenz herauszufinden.
  4. Das Southern-Blotting funktioniert nach dem Prinzip der Hybridisierung auf der Kehrseite. Western Blot arbeitet nach dem Prinzip der Immunodetektionsmethode oder der Antigen-Antikörper-Wechselwirkung.
  5. Eine einzelsträngige DNA oder manchmal RNA wird als Sonde beim Southern-Blotting auf der anderen Seite verwendet, beim Western-Blotting werden primäre und sekundäre Antikörper als Sonde verwendet.
  6. Die Agarose-Gelelektrophorese wird beim Southern-Blotting verwendet, während die SDS-PAGE / Polyacrylamid-Gel zum Trennen von Proteinen beim Western-Blotting verwendet wird.
  7. Das Southern-Blotting folgt andererseits dem Kapillartransfer-Verfahren; Western Blotting folgt dem elektrischen Übertragungsverfahren.
  8. Während des Southern-Blots muss die Probe denaturiert werden, während sich die Probe während des Western-Blots im nativen Zustand befinden sollte.
  9. Beim Southern-Blotting auf der Rückseite ist kein Schritt wie das Blockieren beteiligt. Beim Western-Blotting werden unspezifische Antikörperstellen mit Hilfe von Milchpulver oder Rinderserumalbumin (BSA) auf dem Nitrocellulosepapier blockiert.
  10. Übliche Markierungsmethoden, die beim Southern-Blotting verwendet werden, sind die Verwendung von chromogenen Farbstoffen oder die radioaktive Markierung oder fluoreszierende Markierung usw., während Markierungsmethoden, die beim Western-Blotting verwendet werden, die Verwendung von fluoreszenzmarkierten Antikörpern oder radioaktiven Markierungen, chromogenen Farbstoffen oder die Bildung von Diaminobenzidin usw. sind.
  11. Detektion von Licht, Autoradiographie und Farbänderungen werden als Detektionsmethoden beim Southern Blotting verwendet, während Detektionsmethoden beim Western Blotting Farbänderungen und Detektion von Licht usw. sind.
  12. Southern-Blotting wird beim DNA-Nachweis, Vaterschaftstest, DNA-Fingersatz, zur Identifizierung von Opfern, zur Identifizierung von Straftätern, zum Auffinden von Infektionserregern und zur Identifizierung von Mutationen oder Genumlagerungen usw. verwendet Mischung, um das Vorhandensein von HIV, Viren und Bakterien usw. im Serum nachzuweisen, um defekte Proteine ​​herauszufinden und als eindeutiges Maß für Herpes, Hepatitis B, Lyme-Borreliose und Creutzfeldt-Jacob-Krankheit usw. zu verwenden.

Fazit

Die obige Diskussion fasst zusammen, dass das Southern-Blotting die älteste Blotting-Technik ist, die verwendet wird, um ein spezifisches DNA-Segment in einer Probe herauszufinden, während das Western-Blotting letztere entdeckt und verwendet wurde, um eine spezifische Sequenz von Aminosäuren oder ein spezifisches Protein zu identifizieren.

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